28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2435 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  100 
 
 		 689 aa  1352    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0750  hypothetical protein  44.71 
 
 		 1861 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2800  protein of unknown function DUF11  40.91 
 
 		 1861 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.515437  normal  0.451772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0311  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1063 aa  127  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.427486  decreased coverage  0.00324581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  35.68 
 
 		 898 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  35.29 
 
 		 909 aa  107  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  35.02 
 
 		 2000 aa  87  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  34.22 
 
 		 924 aa  84.3  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  34.89 
 
 		 1984 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  25.23 
 
 		 509 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  30.92 
 
 		 2118 aa  71.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1757 aa  67.8  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1580 aa  62.4  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1278 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1702 aa  54.7  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  31.02 
 
 		 2886 aa  53.9  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  30.85 
 
 		 2853 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1946 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  25 
 
 		 2434 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1809 aa  51.2  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3593  hypothetical protein  36.56 
 
 		 695 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  26.42 
 
 		 2047 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  26.52 
 
 		 3486 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  29.9 
 
 		 733 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1898 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  33.15 
 
 		 1441 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  41.03 
 
 		 8918 aa  44.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  26.45 
 
 		 3324 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>