More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1219 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1219  aminotransferase class-III  100 
 
 		 492 aa  990    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0656786  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  33.91 
 
 		 475 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  38.9 
 
 		 460 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.94 
 
 		 429 aa  237  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  35.94 
 
 		 429 aa  236  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.94 
 
 		 429 aa  236  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.94 
 
 		 459 aa  236  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  35.94 
 
 		 468 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.94 
 
 		 429 aa  236  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  35.94 
 
 		 459 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.94 
 
 		 429 aa  236  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  37.99 
 
 		 467 aa  236  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  39.91 
 
 		 463 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  36.1 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.85 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.85 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.85 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.85 
 
 		 459 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  32.33 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  35.37 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  39.03 
 
 		 411 aa  220  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  40.85 
 
 		 411 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  34.68 
 
 		 475 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  39.06 
 
 		 472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  38.56 
 
 		 477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  33.33 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.85 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  32.98 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  34.34 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  35.53 
 
 		 891 aa  210  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  38.54 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  34.34 
 
 		 472 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  36.77 
 
 		 955 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.07 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.31 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.49 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  33.8 
 
 		 463 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  35.01 
 
 		 394 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  35.01 
 
 		 394 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  36.74 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  34.58 
 
 		 462 aa  193  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  33.83 
 
 		 477 aa  193  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  40.3 
 
 		 845 aa  190  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  36.29 
 
 		 403 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2263  aminotransferase class-III  35.69 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3568  aminotransferase class-III  35.4 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  33.12 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  34.94 
 
 		 392 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  36.61 
 
 		 463 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  34 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01150  acetylornithine aminotransferase, ornithine transaminase (Eurofung)  37.43 
 
 		 476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.202493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  35.47 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  32.59 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  32.33 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  32.33 
 
 		 396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  32.33 
 
 		 396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  32.33 
 
 		 396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  34.01 
 
 		 403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52948  acetylornithine aminotransferase  32.65 
 
 		 452 aa  183  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.346975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.89 
 
 		 391 aa  183  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.13 
 
 		 402 aa  183  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  34.69 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  34.69 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  32.08 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  32.08 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  32.08 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1731  aminotransferase class-III  35.25 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  33.53 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  36.27 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  38.7 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  34.02 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  31.83 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.34 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.58 
 
 		 403 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  38.11 
 
 		 397 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  31.83 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.24 
 
 		 450 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.42 
 
 		 394 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  33.8 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  39.25 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  30.12 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  31.58 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  33.53 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.75 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  36.28 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.69 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  36.44 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  31.83 
 
 		 396 aa  177  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  33.86 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  35.1 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  36.03 
 
 		 438 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  33.53 
 
 		 398 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3279  aminotransferase  32.65 
 
 		 401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  35.15 
 
 		 415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  35.28 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3149  acetylornithine aminotransferase  35.38 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.457305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4916  acetylornithine transaminase protein  34.54 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  39.42 
 
 		 397 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  30.52 
 
 		 402 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>