More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0145 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
247 aa  481  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  43.7 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  42 
 
 
271 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  42 
 
 
271 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  42 
 
 
271 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
281 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  41.73 
 
 
273 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  41.34 
 
 
274 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 
287 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
280 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
280 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
284 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.43 
 
 
279 aa  135  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
270 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
276 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
251 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.99 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.23 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 
270 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
270 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
284 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
274 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.13 
 
 
967 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
291 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
270 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  36.11 
 
 
278 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0560  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
246 aa  122  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 
270 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.16 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
268 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.61 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
286 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 
260 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.69 
 
 
255 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1699  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.1 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.92 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
265 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  37.75 
 
 
261 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1904  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302321  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  37.35 
 
 
261 aa  111  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  35.59 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  39.91 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.53 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.24 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.56 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
262 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.19 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.77 
 
 
260 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 
265 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 
257 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
260 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.09 
 
 
260 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
260 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.23 
 
 
258 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.05 
 
 
261 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.01 
 
 
260 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2691  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
277 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
257 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  37.63 
 
 
256 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.63 
 
 
260 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  37.79 
 
 
261 aa  105  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.27 
 
 
257 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
269 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0652  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.5 
 
 
260 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.74 
 
 
662 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.36 
 
 
297 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 
285 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.7 
 
 
260 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.7 
 
 
261 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>