More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0143 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0143  cytochrome P450  100 
 
 
407 aa  828    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4349  putative cytochrome P450  47.03 
 
 
414 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.546252  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3367  cytochrome P450-like protein  48.55 
 
 
392 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3655  putative cytochrome P450  40.19 
 
 
416 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1965  cytochrome P450  42.05 
 
 
400 aa  252  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  31.2 
 
 
407 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  31.1 
 
 
407 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  31.1 
 
 
407 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.36 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  30.25 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  30.7 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  27.7 
 
 
399 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  29.03 
 
 
405 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  29.03 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  29.03 
 
 
405 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  27.49 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  29.75 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  27.27 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  28.43 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1735  cytochrome P450  27.19 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  29.45 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  28.23 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  29.81 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  28.85 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  29.22 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  28.29 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1478  hypothetical protein  27.03 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  28.76 
 
 
468 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  26.82 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  26.65 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  27.49 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  26.46 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  22.94 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  27.62 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  27.57 
 
 
411 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  30.77 
 
 
419 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  26.51 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  29.46 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  29.23 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  29.94 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  28.71 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  31.17 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0343  cytochrome P450  27.7 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  26.59 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  29.37 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  29.06 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  30.05 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  30.05 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  30 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  28.48 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  27.5 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1485  cytochrome P450  25.44 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1507  cytochrome P450  25.44 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  28.57 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3069  cytochrome P450  26.65 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  27.01 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2018  Acyl transferase  28.53 
 
 
738 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  29.18 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  29.18 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  26.39 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  25.26 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  27.41 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  27.41 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  27.41 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4176  cytochrome P450  25.42 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  28.18 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  26.97 
 
 
429 aa  72.8  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  28.03 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  25.46 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  27.27 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  27.27 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  26.71 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  27.27 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  28.75 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4282  cytochrome P450  24.71 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  27.89 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  28.96 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  28.8 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3515  cytochrome P450  29.93 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  24.24 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  26.94 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  27.3 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  30.21 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  28.96 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  26.94 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0988  cytochrome P450 CYP124E1  29.07 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0798276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  29.35 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3692  cytochrome P450  28.91 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  26.97 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  27.03 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  25.49 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  27.81 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  27.05 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  26.94 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  26.32 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  25.6 
 
 
938 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  26.91 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  26.82 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0359  cytochrome P450  25.86 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  24.47 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>