More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5189 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5189  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7291  ABC transporter related  56.88 
 
 		 277 aa  347  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  54.71 
 
 		 275 aa  325  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1120  ABC transporter related protein  54.26 
 
 		 290 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.429709 
 
 
-
 
NC_002950  PG1010  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.784964 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0586  ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.559058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  32.85 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  33.65 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  30.88 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  31.34 
 
 		 299 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  29.68 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  29.68 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  29.09 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  30.73 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  28.41 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  30.46 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  34.48 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  31.1 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  31 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  30.04 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  29.69 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  27.31 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  29.95 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  35.11 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  31.68 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  30.66 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  29 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  31.55 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  31.77 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  30.85 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  32.16 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  29.68 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  30.81 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  29.86 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  29.31 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  31.89 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  30.14 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  29.68 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  29.68 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  26.52 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  34.11 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  31.08 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  31.34 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.62 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  33 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  29.65 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  29.36 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.3 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  28.91 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  28.91 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  29.23 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  26.72 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  33.64 
 
 		 232 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  31.05 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 341 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  29.21 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  29.47 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  32.21 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  26.82 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.04 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  30.15 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  28.57 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  28.57 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  28.57 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.47 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  28.5 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  29.41 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  31.63 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  30.15 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  29.21 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  28.57 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  32.87 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  31.84 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>