53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5106 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  100 
 
 		 618 aa  1258    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  39.26 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  33.85 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  28.33 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  29.45 
 
 		 618 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  30.97 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  29.19 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  26.73 
 
 		 605 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  28.9 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  28.22 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  26.53 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  29.93 
 
 		 531 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  38.75 
 
 		 534 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  27.4 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  28.42 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 		 513 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  35.14 
 
 		 727 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  27.69 
 
 		 658 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  23.29 
 
 		 546 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  23.29 
 
 		 546 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  24.7 
 
 		 557 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  23.43 
 
 		 486 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  28.66 
 
 		 529 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  31.01 
 
 		 516 aa  53.9  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  31.01 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  31.01 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  27.59 
 
 		 593 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  30.23 
 
 		 516 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  30.23 
 
 		 516 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  29.37 
 
 		 544 aa  50.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  24.55 
 
 		 563 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  34.62 
 
 		 557 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  29.14 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  25.52 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  27.27 
 
 		 531 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  34.62 
 
 		 557 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  30.33 
 
 		 616 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  27.27 
 
 		 494 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  23.38 
 
 		 526 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  23.08 
 
 		 546 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1856  hypothetical protein  37.18 
 
 		 596 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837751  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  33.61 
 
 		 543 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1830  hypothetical protein  37.18 
 
 		 596 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  23.78 
 
 		 592 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  25.84 
 
 		 569 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  23.78 
 
 		 592 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  28.66 
 
 		 523 aa  44.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  28.75 
 
 		 508 aa  44.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4738  glycosyl transferase family 39  26.11 
 
 		 830 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  27.75 
 
 		 512 aa  44.3  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3622  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 694 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>