More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4503 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  100 
 
 		 643 aa  1309    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  35.29 
 
 		 645 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  34 
 
 		 645 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  39.94 
 
 		 653 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  30.92 
 
 		 659 aa  210  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  37.46 
 
 		 664 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  29.63 
 
 		 638 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 606 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  37.14 
 
 		 687 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  34.22 
 
 		 670 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  42.29 
 
 		 738 aa  180  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  28.72 
 
 		 592 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  28.19 
 
 		 616 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 730 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  26.06 
 
 		 600 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  35 
 
 		 525 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  34.23 
 
 		 270 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  36.24 
 
 		 246 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  22.89 
 
 		 657 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6033  histidine kinase  23.8 
 
 		 726 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  26.07 
 
 		 680 aa  128  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 1229 aa  126  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  32.34 
 
 		 501 aa  125  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  36.92 
 
 		 497 aa  124  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  33.9 
 
 		 518 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  32.63 
 
 		 475 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 1101 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  33.45 
 
 		 481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  33.73 
 
 		 461 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 1226 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 535 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.33 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 461 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  29.48 
 
 		 287 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 485 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  33.96 
 
 		 632 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  35.98 
 
 		 287 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4665  histidine kinase  31.44 
 
 		 306 aa  118  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 480 aa  117  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  33.33 
 
 		 1024 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 610 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  35.15 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  32.39 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 466 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  32.27 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 470 aa  115  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5543  histidine kinase  33.65 
 
 		 637 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.88701  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 459 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  34 
 
 		 381 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  26.22 
 
 		 668 aa  113  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  32.3 
 
 		 585 aa  114  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  31.98 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.49 
 
 		 383 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  31.98 
 
 		 466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 471 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  31.98 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  31.98 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  32.34 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  32.77 
 
 		 740 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  34.83 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 575 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  33.82 
 
 		 458 aa  112  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  31.15 
 
 		 526 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 575 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1557  putative signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 273 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 485 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5408  histidine kinase  34.36 
 
 		 494 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0406252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 357 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 700 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  34.87 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  33 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  30.08 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  32.23 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  32.05 
 
 		 447 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 478 aa  109  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 339 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.54 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 357 aa  108  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  31.84 
 
 		 470 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.94 
 
 		 456 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>