More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4340 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  81.29 
 
 		 155 aa  272  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  80 
 
 		 155 aa  272  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  79.35 
 
 		 155 aa  267  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  65.19 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  64.56 
 
 		 158 aa  220  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1941  30S ribosomal protein S7  65.82 
 
 		 158 aa  219  8e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  65.16 
 
 		 155 aa  216  6e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0400  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 		 158 aa  214  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  63.87 
 
 		 155 aa  213  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  62.16 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  197  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  62.16 
 
 		 156 aa  197  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  60.81 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 		 157 aa  192  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 		 155 aa  189  9e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0272  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.432697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  53.55 
 
 		 155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3999  ribosomal protein S7  57.24 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000436964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0754  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1709  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0357  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0343  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2538  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.655975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2376  30S ribosomal protein S7  60.69 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000622465  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0458  ribosomal protein S7  51.3 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312429  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0576  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.688542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0240  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>