More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4092 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  100 
 
 
190 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5094  adenylate kinase  68.84 
 
 
202 aa  281  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  64.55 
 
 
195 aa  244  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0068  adenylate kinase  57.37 
 
 
200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  52.13 
 
 
190 aa  208  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  53.19 
 
 
367 aa  204  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3381  adenylate kinase  52.66 
 
 
189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  52.66 
 
 
374 aa  198  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  46.52 
 
 
188 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  45.7 
 
 
189 aa  185  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1863  adenylate kinase  46.03 
 
 
389 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  43.06 
 
 
213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  47.18 
 
 
193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  43.19 
 
 
215 aa  177  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  47.09 
 
 
360 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  45.99 
 
 
206 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  46.39 
 
 
367 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  44.39 
 
 
187 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  46.67 
 
 
341 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  40.85 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  43.81 
 
 
208 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  43.81 
 
 
195 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  42.31 
 
 
215 aa  169  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  41.67 
 
 
200 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  43.55 
 
 
187 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  42.16 
 
 
192 aa  168  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  43.01 
 
 
187 aa  168  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  46.2 
 
 
191 aa  167  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  40.65 
 
 
213 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  39.62 
 
 
215 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  44.69 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  45.99 
 
 
335 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0266  hypothetical protein  40.11 
 
 
193 aa  165  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.500283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  41.63 
 
 
216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  42.78 
 
 
309 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  42.71 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  41.24 
 
 
200 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  42.93 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  42.78 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  40.65 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  43.35 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  37.79 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  41.49 
 
 
181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  41.05 
 
 
192 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  41.15 
 
 
216 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  39.62 
 
 
227 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  43.32 
 
 
199 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  41.15 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  44.63 
 
 
182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  40.67 
 
 
216 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  40.67 
 
 
216 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  40.67 
 
 
216 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  40.67 
 
 
216 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  40.67 
 
 
216 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  40.67 
 
 
216 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  40.67 
 
 
216 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  42.54 
 
 
182 aa  160  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  40.2 
 
 
217 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  40.67 
 
 
216 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  40.19 
 
 
213 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  40.67 
 
 
216 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  39.05 
 
 
216 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  38.32 
 
 
213 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  40.1 
 
 
200 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  40.38 
 
 
423 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  42.49 
 
 
191 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  39.07 
 
 
217 aa  158  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  39.36 
 
 
197 aa  158  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  40.2 
 
 
217 aa  157  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  39.58 
 
 
200 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  39.34 
 
 
217 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  39.34 
 
 
217 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  40.19 
 
 
217 aa  157  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  40.74 
 
 
185 aa  157  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  43.01 
 
 
181 aa  157  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  43.48 
 
 
183 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  39.25 
 
 
214 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  40 
 
 
192 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  41.01 
 
 
189 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  42.33 
 
 
183 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  40.19 
 
 
214 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1110  adenylate kinase  42.93 
 
 
182 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  39.05 
 
 
216 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  39.47 
 
 
186 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  41.05 
 
 
193 aa  154  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  37.5 
 
 
229 aa  154  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  40.86 
 
 
181 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  38.59 
 
 
193 aa  154  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  39.57 
 
 
191 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  37.62 
 
 
211 aa  153  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  38.5 
 
 
214 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  37.67 
 
 
217 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  36.79 
 
 
217 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  36.84 
 
 
213 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  39.8 
 
 
205 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  41.71 
 
 
195 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19841  adenylate kinase  42.39 
 
 
182 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.966566  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  38.57 
 
 
217 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  38.73 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  38.89 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>