More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1303 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1303  prephenate dehydratase  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1437  prephenate dehydratase  96.74 
 
 		 276 aa  552  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  93.12 
 
 		 276 aa  534  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1937  Chorismate mutase  41.91 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1513  Prephenate dehydratase  38.75 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.807541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  35.79 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.15 
 
 		 358 aa  191  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0764  prephenate dehydratase  37.36 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.441795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07375  putative prefrenate dehydratase  38.66 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  37.36 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.41 
 
 		 358 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.64 
 
 		 632 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  39.56 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.03 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0517  prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.72305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  38.77 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  36.4 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  40 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1056  Prephenate dehydratase  37.27 
 
 		 284 aa  168  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  35.16 
 
 		 392 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  35.58 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  35.58 
 
 		 380 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.8 
 
 		 392 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.43 
 
 		 391 aa  165  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  36.09 
 
 		 379 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  34.69 
 
 		 391 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  35.64 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  34.19 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.56 
 
 		 358 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.35 
 
 		 371 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  33.11 
 
 		 304 aa  155  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  33.82 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  35.06 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.19 
 
 		 358 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  34.56 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  31.99 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2913  chorismate mutase  34.96 
 
 		 648 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  36.16 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  34.66 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.19 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  34.07 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  35.66 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  33.7 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  31.62 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  32.1 
 
 		 355 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1221  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.43 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  33.47 
 
 		 356 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  32.96 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1263  chorismate mutase  34.59 
 
 		 662 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  35.64 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  30.91 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  33.58 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  32.73 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1367  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.95 
 
 		 671 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2828  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.95 
 
 		 667 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2910  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.95 
 
 		 667 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3007  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.95 
 
 		 667 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  31.02 
 
 		 385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.85 
 
 		 386 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0898  prephenate dehydratase / chorismate mutase / phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.19 
 
 		 659 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.57 
 
 		 386 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  31.62 
 
 		 364 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  35.27 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  31.62 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  31.62 
 
 		 364 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  33.09 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30 
 
 		 362 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.27 
 
 		 396 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  32.1 
 
 		 355 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  31.34 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  31.39 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  31.25 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_004310  BR0037  prephenate dehydratase  32.12 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.51728  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  31.85 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2853  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.5 
 
 		 393 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  31.25 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0037  prephenate dehydratase  32.12 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  30.88 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  32.84 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  30.26 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1168  chorismate mutase  33.46 
 
 		 662 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.51 
 
 		 373 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  34.31 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  30.63 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1072  chorismate mutase  33.21 
 
 		 654 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 386 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  32.49 
 
 		 386 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 386 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 386 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 386 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  32.49 
 
 		 386 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  30.51 
 
 		 364 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 386 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1334  prephenate dehydratase  34.91 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.49 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  32.22 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  33.33 
 
 		 418 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>