216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1487 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
207 aa  431  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0173  multimeric flavodoxin WrbA  65.22 
 
 
206 aa  289  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000913866  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  55.56 
 
 
206 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  55.07 
 
 
206 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3584  NADPH-dependent FMN reductase  52.83 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000299171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2588  NADPH-dependent FMN reductase  55.92 
 
 
210 aa  227  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122146  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  56.04 
 
 
208 aa  227  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0948  NADPH-dependent FMN reductase  53.55 
 
 
211 aa  214  8e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105461  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1620  NADPH-dependent FMN reductase  52.61 
 
 
211 aa  210  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  51.67 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  44.98 
 
 
208 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  43.93 
 
 
211 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  44.39 
 
 
211 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  44.34 
 
 
211 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  45.28 
 
 
211 aa  188  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1959  NADPH-dependent FMN reductase  45.75 
 
 
211 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.783003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  47.17 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  44.5 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  44.39 
 
 
191 aa  160  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  43.32 
 
 
193 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  42.11 
 
 
191 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  43.41 
 
 
188 aa  148  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  41.8 
 
 
192 aa  147  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
191 aa  147  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
191 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  41.03 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  38.74 
 
 
193 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  40.91 
 
 
200 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  39.89 
 
 
192 aa  141  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  39.68 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  38.62 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  38.17 
 
 
198 aa  134  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  39.57 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  40.43 
 
 
194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  37.97 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  39.27 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  37.44 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  37.43 
 
 
190 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
190 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  33.68 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  37.19 
 
 
194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  37.89 
 
 
207 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  36.36 
 
 
190 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  34.97 
 
 
189 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  36.41 
 
 
189 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
189 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
193 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  29.17 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  32.26 
 
 
192 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 
193 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  28.19 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  28.27 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  27.18 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  36.75 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  41.12 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  26.8 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0630  NADPH-dependent FMN reductase  24.73 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  28.95 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  29.8 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  28.14 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  25.63 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  36.27 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  26.18 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07470  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  25.85 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  22.4 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  26.8 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  34.82 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  26.52 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  25.27 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  31.82 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  26.9 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  26.21 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
212 aa  61.6  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
224 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
210 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  26.99 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  34.55 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  34.31 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04910  NADPH-dependent FMN reductase  28.92 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.799162  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  31.86 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  29.32 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  32.71 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  28.77 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  28.18 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>