78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3396 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3396  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  784    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7136  hypothetical protein  29.79 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000678278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3914  Sigma 54 interacting domain protein  24.1 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000232592  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0071  ABC transporter, ATP-binding protein  28.66 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3609  AAA ATPase  27.72 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.687866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.2 
 
 		 541 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1946  ABC transporter related protein  24.55 
 
 		 744 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  24.26 
 
 		 273 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3762  ABC transporter related  23.3 
 
 		 632 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0197  FeS assembly ATPase SufC  29.2 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  24.39 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  26.95 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  25.83 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1011  ABC transporter related  26.49 
 
 		 636 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.954717  normal  0.0514719 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  24.71 
 
 		 252 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  31.58 
 
 		 550 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  26.04 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  25.97 
 
 		 281 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  26.55 
 
 		 263 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  26.25 
 
 		 253 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  26.44 
 
 		 239 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  24.37 
 
 		 563 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0677  ABC transporter related  29.91 
 
 		 218 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.012706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  29.3 
 
 		 658 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  28.85 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  24.63 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  25 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  29.63 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3061  ABC transporter related  32.03 
 
 		 663 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0828579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  27.68 
 
 		 606 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  24.59 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  26.49 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  25.1 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  32.41 
 
 		 623 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.17 
 
 		 555 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  24.18 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  24.22 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  32.28 
 
 		 640 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  23.44 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  21.59 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  26.54 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  22.75 
 
 		 259 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  23.19 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2014  ABC transporter related  30.93 
 
 		 534 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0103436  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  25.47 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  27.75 
 
 		 531 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  27.23 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 		 514 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  25.29 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  23.33 
 
 		 620 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  24.6 
 
 		 241 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00811  ABC transporter, ATP binding component  25.47 
 
 		 260 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  23.33 
 
 		 620 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  30.25 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  28.1 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7412  ABC efflux pump, ATPase subunit  27.49 
 
 		 236 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  28.49 
 
 		 635 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  27.43 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1677  inner membrane ABC transporter ATP-binding protein  28.97 
 
 		 561 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  24.84 
 
 		 253 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  30.4 
 
 		 595 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1648  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 223 aa  43.5  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  24.84 
 
 		 253 aa  43.5  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1736  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  26.67 
 
 		 261 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  28.39 
 
 		 619 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  24.84 
 
 		 253 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2983  ABC transporter related  26.34 
 
 		 653 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  26.37 
 
 		 252 aa  43.1  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0904  FeS assembly ATPase SufC  26.61 
 
 		 272 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  25.93 
 
 		 251 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0040  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.21 
 
 		 233 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  27.06 
 
 		 605 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5638  ABC transporter related  27.98 
 
 		 236 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6003  ABC transporter related  27.98 
 
 		 236 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 		 514 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  24.76 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  28.3 
 
 		 247 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.21 
 
 		 272 aa  42.7  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>