More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2455 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
455 aa  926    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  54.26 
 
 
408 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  37.23 
 
 
412 aa  264  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  37.92 
 
 
407 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  38.04 
 
 
415 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 
425 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 
283 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  44.91 
 
 
287 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  43.51 
 
 
291 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  42.44 
 
 
289 aa  226  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  42.38 
 
 
291 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  42.25 
 
 
289 aa  217  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  34.8 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  42.36 
 
 
352 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  38.41 
 
 
353 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  36.82 
 
 
286 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  37.41 
 
 
373 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
291 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 
284 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 
378 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 
279 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  33.09 
 
 
284 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  32.75 
 
 
369 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
284 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  33.21 
 
 
280 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
280 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  32.23 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  31.06 
 
 
281 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  28.72 
 
 
517 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 
284 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  31.2 
 
 
279 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.81 
 
 
280 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 
282 aa  126  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
284 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
279 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 
299 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 
300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 
299 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  26.56 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  30.5 
 
 
650 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
290 aa  116  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.08 
 
 
280 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  29.6 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  30.83 
 
 
282 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  31.62 
 
 
358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 
292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  29.25 
 
 
281 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 
285 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.79 
 
 
297 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  31.4 
 
 
287 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 
285 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.41 
 
 
505 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  29.9 
 
 
283 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 
297 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  29.47 
 
 
276 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 
282 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 
297 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.25 
 
 
303 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
284 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  30.46 
 
 
716 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
287 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
293 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
285 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.79 
 
 
297 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  29.86 
 
 
302 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  26.37 
 
 
284 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  34.84 
 
 
275 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 
340 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  31.58 
 
 
293 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  23.72 
 
 
298 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.44 
 
 
275 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
297 aa  98.2  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  26.16 
 
 
313 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  27.48 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  27.76 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  27.97 
 
 
285 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  28.37 
 
 
512 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.09 
 
 
292 aa  94.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28.06 
 
 
302 aa  93.2  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  28.19 
 
 
290 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  29.23 
 
 
282 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  25.65 
 
 
283 aa  90.9  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  27.17 
 
 
456 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  31.94 
 
 
288 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 
288 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  31.91 
 
 
288 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  25.61 
 
 
280 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 
544 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  31.3 
 
 
273 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  29.27 
 
 
287 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 
282 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  26.26 
 
 
422 aa  86.7  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  26.84 
 
 
718 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  31 
 
 
276 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>