More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2047 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2047  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  330  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0813552  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1252  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1704  protein of unknown function UPF0079  46.62 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44845  normal  0.0233413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0277  protein of unknown function UPF0079  50.28 
 
 		 225 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0902119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1852  protein of unknown function UPF0079  48.03 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.562422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1142  protein of unknown function UPF0079  48 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  35.06 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  33.77 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  39.82 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  37.58 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  37.3 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  35.03 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  37.24 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  38.22 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  34.38 
 
 		 153 aa  72  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  35.53 
 
 		 540 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  40.71 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  36.49 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  33.12 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  38.85 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  38.85 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.42 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  38.26 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  41.67 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  31.93 
 
 		 505 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  37.91 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  29.75 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  29.11 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  37.41 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  36.49 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  31.85 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  39.84 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  31.91 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  32.21 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  37.84 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  33.33 
 
 		 497 aa  67.8  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  38.84 
 
 		 195 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  29.08 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  34.59 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  34.93 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  34.59 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  34.68 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  39.58 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  34.59 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  35.86 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  38 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  32.64 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  34.38 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0674  protein of unknown function UPF0079  36.91 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  31.61 
 
 		 503 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  41.44 
 
 		 523 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  36.91 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  34.59 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  35.66 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  34.69 
 
 		 549 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  42.06 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  28.86 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  36.69 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0628  protein of unknown function UPF0079  36.24 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00803153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  36.69 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  29.86 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  34.59 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  37.09 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  37.04 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  28.39 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  38.33 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  43 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  34.25 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  35.09 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  35.09 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  35.92 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  39.37 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  35.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  39.81 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  35 
 
 		 542 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  38.14 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  35.4 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  32.93 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  33.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  33.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  31.97 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.61 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  33.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  35.94 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  38.1 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  37.23 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  35 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  35.57 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  33.96 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  44.44 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  36.94 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  30.83 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>