62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1676 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  73.4 
 
 		 511 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 426 aa  881    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  74.35 
 
 		 491 aa  678    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  60.57 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  61.11 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  60.81 
 
 		 423 aa  528  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  48.36 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  45.65 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  44.66 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  41.61 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  40.05 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  41.9 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  39.95 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  40.33 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  39.95 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  39.39 
 
 		 440 aa  292  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 		 418 aa  274  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  40.1 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  38 
 
 		 446 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 427 aa  262  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  37.94 
 
 		 446 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  38 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  38.58 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  28.22 
 
 		 215 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.33 
 
 		 334 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.16 
 
 		 327 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1706  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 370 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0251054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1815  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0519  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 360 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2864  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2803  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000449435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00347388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2492  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0107198  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.72 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.43 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.38 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2194  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 370 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734508  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.79 
 
 		 369 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2919  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.38 
 
 		 370 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00151708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.29 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.15 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.41 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  22.35 
 
 		 269 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  26.47 
 
 		 206 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.36 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.55 
 
 		 326 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2441  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.84 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.56 
 
 		 309 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 		 332 aa  43.5  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  22.75 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0257  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.02 
 
 		 315 aa  43.5  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.862128  normal  0.0494726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.67 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.48 
 
 		 326 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2659  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.54 
 
 		 386 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00949388  normal  0.0744844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 360 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 394 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>