73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1194 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1194  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0931716  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.4 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69590  putative ABC-type amino acid transporter  29.38 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.233272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  22.3 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  21.75 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  24.69 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.53 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  21.93 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  21.75 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  21.93 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1316  hypothetical protein  30.7 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  21.93 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  27.78 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  27.78 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  29.25 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  27.78 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  22.64 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.01 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.01 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  24.71 
 
 		 261 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  25.56 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  25.56 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  20.98 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  25.56 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  26.09 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  26.09 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  22.03 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  25.93 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  24.81 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0716  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0631  hypothetical protein  27.49 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.05 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  26.34 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6012  putative lipoprotein  25.77 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.32 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  20.66 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  21.66 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  24.44 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0311  extracellular solute-binding protein family 3  25.58 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  22.26 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  22.6 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  21.88 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1862  hypothetical protein  23.29 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0011565  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.5 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  19.22 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  21.83 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  20.44 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  24.32 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  26.06 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  21.68 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  21.68 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.73 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  18.82 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  18.82 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  18.82 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  18.82 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  20.27 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  19.07 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  21.24 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  25 
 
 		 263 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  26.28 
 
 		 255 aa  42  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  25.53 
 
 		 256 aa  42  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  20.95 
 
 		 502 aa  42  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  20.95 
 
 		 502 aa  42  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>