More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0246 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  100 
 
 
266 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  90.19 
 
 
265 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  78.87 
 
 
266 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  77.74 
 
 
266 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  75.56 
 
 
269 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  75.56 
 
 
269 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  75.56 
 
 
269 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  74.81 
 
 
266 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  74.44 
 
 
266 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  74.44 
 
 
266 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  74.44 
 
 
266 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  74.44 
 
 
266 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  74.44 
 
 
266 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  74.44 
 
 
266 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  74.06 
 
 
266 aa  424  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  74.44 
 
 
266 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  73.68 
 
 
266 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  71.7 
 
 
266 aa  408  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  53.46 
 
 
274 aa  292  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  53.23 
 
 
275 aa  285  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  51.92 
 
 
270 aa  274  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  49.06 
 
 
265 aa  268  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  47.94 
 
 
266 aa  266  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  37.93 
 
 
272 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  40.67 
 
 
273 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  40.6 
 
 
274 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
274 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  40.6 
 
 
274 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  41.2 
 
 
274 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  40.23 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  40.23 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  37.35 
 
 
281 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  40.67 
 
 
280 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  40.3 
 
 
273 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  40.3 
 
 
273 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  39.93 
 
 
273 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  40.3 
 
 
273 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  40.3 
 
 
273 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  40.3 
 
 
273 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  40.3 
 
 
273 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  40.84 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  40.84 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  40.84 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  39.33 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  40.84 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  40.46 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  40.84 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  40.84 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  40.84 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  39.93 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  40.08 
 
 
274 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  38.95 
 
 
273 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  40.38 
 
 
272 aa  178  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  39.34 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  39.16 
 
 
272 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  39.16 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  39.16 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  38.78 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  38.78 
 
 
272 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  35.66 
 
 
265 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  39.83 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  36.54 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  36.15 
 
 
273 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  36.15 
 
 
273 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  33.21 
 
 
266 aa  148  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.71 
 
 
293 aa  133  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  30.37 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.08 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  29.96 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  27.76 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.38 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  26.44 
 
 
269 aa  105  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  29.93 
 
 
286 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  29.93 
 
 
286 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  29.93 
 
 
286 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  30.5 
 
 
286 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  29.56 
 
 
272 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  29.56 
 
 
286 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
276 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.3 
 
 
273 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.68 
 
 
273 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  29.02 
 
 
270 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  28.68 
 
 
273 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  27.92 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.3 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  28.37 
 
 
267 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  28.47 
 
 
272 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  28.47 
 
 
272 aa  99  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  28.47 
 
 
272 aa  99  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  28.47 
 
 
272 aa  99  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  28.47 
 
 
272 aa  99  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  29.07 
 
 
273 aa  98.6  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  28.47 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  29.45 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  27.54 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  27.54 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  28.1 
 
 
306 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  28.3 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>