More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2998 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2998  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2802  extracellular solute-binding protein  51.28 
 
 		 273 aa  278  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.602775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.88 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0974  extracellular solute-binding protein  48.51 
 
 		 273 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0657  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  50.2 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0691  extracellular solute-binding protein  50.2 
 
 		 273 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5122  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123771  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2850  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2580  extracellular solute-binding protein  40.07 
 
 		 279 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.862888  normal  0.479184 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3265  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5509  extracellular solute-binding protein family 3  37.5 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011689 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.13 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  38.61 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  39.27 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.22 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.02 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.68 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.84 
 
 		 264 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  35.57 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  34.94 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  37.08 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  33.83 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  34.9 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.4 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  34.07 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  34.07 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  34.07 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  33.82 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  34.07 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.03 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  33.09 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  33.09 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.97 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.71 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  33.83 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  33.83 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  33.83 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  33.33 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  33.09 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.71 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 		 285 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  33.86 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.71 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  33.86 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  33.86 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  33.33 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  34.26 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 		 266 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.22 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  33.21 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0246  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.469708 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0240  extracellular solute-binding protein family 3  36.14 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  33.58 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  32.96 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  34.25 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  34.25 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  34.25 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  33.46 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.14 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.14 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  32.22 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.75 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00359  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  33.06 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.580904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1602  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  31.6 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  32.48 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  29.55 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  32.75 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>