More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2276 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  88.44 
 
 
401 aa  681    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  100 
 
 
398 aa  787    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  83.17 
 
 
401 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  82.66 
 
 
401 aa  615  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  77.89 
 
 
401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  77.89 
 
 
401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  77.89 
 
 
401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  74.87 
 
 
402 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  74.87 
 
 
402 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2535  multidrug resistance protein MdtH  74.87 
 
 
402 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  normal  0.203452 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  74.87 
 
 
402 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  74.87 
 
 
402 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1188  multidrug resistance protein MdtH  74.87 
 
 
402 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.812353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  74.87 
 
 
402 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1444  multidrug resistance protein MdtH  74.87 
 
 
402 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  hitchhiker  0.006681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  74.87 
 
 
402 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  75 
 
 
402 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  74.75 
 
 
402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  74.75 
 
 
402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  74.75 
 
 
402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  74.75 
 
 
402 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  74.24 
 
 
402 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  76.4 
 
 
401 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0239  multidrug resistance protein MdtH  69.82 
 
 
411 aa  532  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  41.12 
 
 
414 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  43.25 
 
 
408 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 
406 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0900  major facilitator transporter  29.43 
 
 
420 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1445  major facilitator transporter  29.11 
 
 
419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1463  major facilitator superfamily transporter  29.11 
 
 
419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0911464  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5855  major facilitator superfamily transporter  29.21 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4559  major facilitator transporter  28.05 
 
 
421 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0291  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
422 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.63 
 
 
393 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  26.67 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.07 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1048  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137816  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  22.07 
 
 
395 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  21.75 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  21.75 
 
 
393 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  22.34 
 
 
398 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.87 
 
 
399 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.81 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  22.87 
 
 
397 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  27.7 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  24.87 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  28.3 
 
 
426 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4425  major facilitator transporter  28.19 
 
 
418 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.226942  normal  0.426578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4198  major facilitator transporter  28.19 
 
 
418 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  24.47 
 
 
393 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4264  major facilitator superfamily transporter  28.19 
 
 
418 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396919  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  27.97 
 
 
426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10866  integral membrane transport protein  25.33 
 
 
419 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.25313  hitchhiker  0.00190628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  28.13 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.84 
 
 
424 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  28.97 
 
 
423 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
423 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.3 
 
 
423 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
423 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
423 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.33 
 
 
424 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  27.78 
 
 
423 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  27.78 
 
 
423 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.04 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.29 
 
 
424 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.44 
 
 
423 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 
419 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  25.35 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  25.21 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  25.21 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  25.21 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  25 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.86 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  23.97 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  24.92 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.27 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.1 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
457 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  22.99 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.31 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  26.7 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  26.7 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  26.7 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  25.36 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  25.55 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  24.94 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  21.81 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>