40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1636 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  100 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  56.43 
 
 
287 aa  311  7.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  48.52 
 
 
297 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  48.23 
 
 
295 aa  248  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  48.4 
 
 
288 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  48.4 
 
 
288 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  46.3 
 
 
297 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  42.65 
 
 
289 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  41.12 
 
 
274 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  41.12 
 
 
274 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  42 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  40.65 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  41.5 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  39.15 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  39.7 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  38.68 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  38.68 
 
 
274 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  38.68 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  38.68 
 
 
274 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  38.68 
 
 
274 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  38.68 
 
 
274 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  38.68 
 
 
274 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  35.98 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  27.05 
 
 
293 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  21.92 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  26.2 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  22.09 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  27.95 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  24.34 
 
 
238 aa  56.6  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  52.08 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  29.15 
 
 
324 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  52.08 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  23.02 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  24.68 
 
 
568 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  47.92 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  27.43 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  43.64 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  33.8 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  25.56 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>