65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0869 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
305 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  41.83 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  35.95 
 
 
316 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  43.18 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  35.68 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  35.29 
 
 
306 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4801  hypothetical protein  38.63 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4715  hypothetical protein  38.63 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  35.32 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  38.2 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  34.3 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  32.47 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  32.13 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  32.55 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  32.88 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
329 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 
340 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  32.84 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4843  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000540722  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3657  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3141  serine/threonine protein kinase  25.28 
 
 
355 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.165863  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  31.13 
 
 
298 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4166  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0215875  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  38.89 
 
 
334 aa  46.2  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  58.82 
 
 
341 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  28.94 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4092  serine/threonine protein kinase  35 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0621  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3322  serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0361753  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3969  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00010799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0409  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0359  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518063  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  29.52 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00403  serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0385  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000846832  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3582  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4194  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129654  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0332  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  34.62 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0399  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.346244  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3643  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0800606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0301  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.620719  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3839  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4890  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
328 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000036631  hitchhiker  0.000000828535 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0045  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5180  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000688242  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06330  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000269191  normal  0.792166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4229  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3160  serine/threonine protein kinase  56.76 
 
 
338 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0589  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4519  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
328 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  44.12 
 
 
243 aa  42.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0552  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
360 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0284  serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 
329 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0264  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
333 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.131936  hitchhiker  0.00470067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>