156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3144 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 281 aa  541  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  41.49 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.25 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  32.6 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  36.02 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  34.89 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  34.25 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  33.97 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  35.03 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.05 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  38.12 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.05 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  32.8 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  34.72 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  36.41 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  33.11 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  30.28 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  31.09 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  31.09 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  33.99 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  30.58 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.57 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  38.71 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  25.77 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  29.03 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  27.24 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  34.81 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  29.37 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  29.05 
 
 		 297 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  23.79 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  26.21 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  27.15 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  22.91 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  28.01 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  23.86 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  26.8 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  29.46 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  21.53 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.3 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  26.8 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  28.43 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  23.1 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  23.38 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  24.88 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.24 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.22 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  23.03 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  25.32 
 
 		 311 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.93 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  27.52 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  22.3 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.43 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  22.66 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  23.53 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  22.3 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.3 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  25.25 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  22.83 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.2 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  23.81 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  29.38 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  24.46 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  27.48 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  27.48 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.09 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  27.48 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  27.48 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  27.48 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  27.48 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  27.48 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  23.32 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0350  hypothetical protein  26.23 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  23.81 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0332  hypothetical protein  26.23 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  25.49 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  21.52 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.42 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  24.74 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  26.17 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  26.15 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  23.56 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.11 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  22.65 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  22.54 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  22.22 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  23.01 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  22.65 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  25.49 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  25.49 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  30.49 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>