More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1734 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  100 
 
 
407 aa  832    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  56.75 
 
 
419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  55.5 
 
 
407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  57 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  55.86 
 
 
414 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  39.55 
 
 
397 aa  296  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  36.78 
 
 
397 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  36.87 
 
 
397 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  38.85 
 
 
399 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  37.63 
 
 
397 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  38.54 
 
 
397 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  36.04 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  38.07 
 
 
398 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  36.92 
 
 
399 aa  264  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  38.9 
 
 
397 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  34.28 
 
 
397 aa  256  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  36.29 
 
 
395 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  36.99 
 
 
398 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  35.66 
 
 
400 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  34.81 
 
 
385 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  31.75 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  32.91 
 
 
389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  35.99 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  29.92 
 
 
397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  31.82 
 
 
397 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  31.01 
 
 
397 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  33.92 
 
 
405 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  31.44 
 
 
390 aa  186  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  30.08 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  32.39 
 
 
396 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  31.03 
 
 
390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  30.41 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  30.28 
 
 
396 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  31.19 
 
 
388 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  29.31 
 
 
397 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  30.83 
 
 
402 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  30.67 
 
 
388 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  30.89 
 
 
397 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  29.08 
 
 
396 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  29.52 
 
 
396 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  29.9 
 
 
398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  31.18 
 
 
394 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  27.7 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  25.71 
 
 
357 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  28.72 
 
 
347 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  25 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.61 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  32.47 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  24.42 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  24.1 
 
 
364 aa  84  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  27.79 
 
 
356 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  27.46 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  22.4 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  29.24 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  30.18 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  27.14 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  26.97 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  25.43 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  28.52 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  27.89 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  27.88 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  24.84 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  26.95 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  27.71 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  23.51 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  30.26 
 
 
353 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  28.29 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  28.68 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  28.29 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.23 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  28.29 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  24.49 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  28.29 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  27.22 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  28.29 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  24.62 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.94 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  27.91 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  22.96 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  25.58 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  24.35 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  26.68 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.36 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.94 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  26.35 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  25.56 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  27.04 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.65 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.65 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  24.54 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.65 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  25.44 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  25.26 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.57 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  25.93 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  24.4 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  28.19 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  28.76 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  28.29 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.65 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>