More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0562 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
453 aa  917    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.11 
 
 
473 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1653  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.98 
 
 
456 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000183758  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1580  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.78 
 
 
456 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.809434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1690  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 
460 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416898  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1416  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.05 
 
 
461 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.5 
 
 
472 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.82 
 
 
458 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 
474 aa  247  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.9 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.91 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.92 
 
 
468 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.04 
 
 
482 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 
472 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  33.63 
 
 
464 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.46 
 
 
459 aa  239  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.25 
 
 
473 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1632  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.73 
 
 
483 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.4 
 
 
470 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.06 
 
 
467 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.08 
 
 
459 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.08 
 
 
459 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.3 
 
 
459 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.69 
 
 
473 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1494  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.22 
 
 
473 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 
470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 
470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 
470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.99 
 
 
462 aa  236  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.63 
 
 
459 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.73 
 
 
465 aa  234  3e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.06 
 
 
477 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 
467 aa  233  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.66 
 
 
469 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
480 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  35.29 
 
 
462 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.56 
 
 
480 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 
481 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.55 
 
 
473 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  34.68 
 
 
468 aa  232  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.4 
 
 
466 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.69 
 
 
480 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.55 
 
 
473 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
481 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.38 
 
 
463 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 
479 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.63 
 
 
459 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.51 
 
 
467 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
459 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.27 
 
 
467 aa  230  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
479 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
467 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.63 
 
 
477 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
474 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
470 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 
581 aa  230  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
479 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.91 
 
 
468 aa  229  6e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.67 
 
 
458 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.95 
 
 
465 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.14 
 
 
466 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
459 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
470 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 
479 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 
473 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
487 aa  227  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 
461 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.04 
 
 
468 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.72 
 
 
468 aa  227  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
467 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.59 
 
 
459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 
468 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
467 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.57 
 
 
463 aa  226  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
584 aa  226  9e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.29 
 
 
465 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.86 
 
 
462 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.63 
 
 
487 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
481 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.52 
 
 
563 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.52 
 
 
562 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.44 
 
 
470 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.63 
 
 
539 aa  225  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.39 
 
 
481 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
464 aa  224  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 
478 aa  224  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  35 
 
 
467 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.57 
 
 
471 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.86 
 
 
462 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>