160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0415 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0415  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 
452 aa  933    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0179  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  54.25 
 
 
487 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase  53.17 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2851  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.11 
 
 
473 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1961  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  48.44 
 
 
468 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.351083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1775  deoxyribodipyrimidine photolyase  51.91 
 
 
447 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00154316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0527  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  47.49 
 
 
462 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1321  deoxyribodipyrimidine photolyase  49.65 
 
 
469 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.533615  normal  0.0703748 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0876  DNA photolyase, class 2  48.65 
 
 
459 aa  422  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0767  deoxyribodipyrimidine photolyase  47.3 
 
 
451 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.268516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2829  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  49.89 
 
 
461 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1936  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.62 
 
 
494 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0522  DNA photolyase, class 2  43.49 
 
 
495 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.372488 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2693  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.87 
 
 
449 aa  336  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30886  predicted protein  43.25 
 
 
506 aa  331  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.25268 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51952  class II CPD photolyase  40.04 
 
 
511 aa  331  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41733  predicted protein  42.73 
 
 
477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  normal  0.188048 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36787  predicted protein  42.73 
 
 
477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00684152  hitchhiker  0.00249943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3221  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.4 
 
 
448 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147791  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0663  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  39.91 
 
 
464 aa  300  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04990  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.48 
 
 
466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0725  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.28 
 
 
455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4497  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  37.76 
 
 
446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112755  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0155  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.44 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3129  DNA photolyase, FAD-binding  36.91 
 
 
468 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3500  DNA photolyase FAD-binding protein  34.22 
 
 
453 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2139  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.85 
 
 
456 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3762  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.14 
 
 
462 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12101  normal  0.44256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2754  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.31 
 
 
467 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.853539 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45715  predicted protein  39.12 
 
 
467 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.380145  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2531  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.18 
 
 
467 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2716  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.86 
 
 
490 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2459  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.88 
 
 
467 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6363  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.36 
 
 
465 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.111638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1430  DNA photolyase FAD-binding protein  33.33 
 
 
493 aa  227  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4973  DNA photolyase FAD-binding protein  33.47 
 
 
496 aa  219  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3226  DNA photolyase FAD-binding  34.63 
 
 
486 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3028  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type II  33.88 
 
 
490 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3125  DNA photolyase FAD-binding  34.16 
 
 
486 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.848481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3007  DNA photolyase FAD-binding  33.26 
 
 
493 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  30.79 
 
 
843 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1907  DNA photolyase, class 2  42.11 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.52 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.39 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.35 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.45 
 
 
469 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  24.3 
 
 
469 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.55 
 
 
479 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.51 
 
 
481 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.16 
 
 
493 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.61 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.68 
 
 
477 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.78 
 
 
511 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.03 
 
 
474 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.43 
 
 
434 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4249  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.4 
 
 
442 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2364  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.12 
 
 
487 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49165  predicted protein  26.97 
 
 
495 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.34 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.66 
 
 
486 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.66 
 
 
476 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.06 
 
 
500 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.86 
 
 
493 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.62 
 
 
499 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.05 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0237  deoxyribodipyrimidine photolyase-like  38.89 
 
 
114 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.969227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.67 
 
 
488 aa  53.9  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1441  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.28 
 
 
474 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.511514  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.28 
 
 
445 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.28 
 
 
445 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.28 
 
 
445 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.52 
 
 
479 aa  53.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.44 
 
 
488 aa  53.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.23 
 
 
505 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  28.11 
 
 
471 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  28.11 
 
 
471 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.51 
 
 
487 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.81 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.03 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  30.32 
 
 
472 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.89 
 
 
478 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.18 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.57 
 
 
499 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.01 
 
 
483 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.84 
 
 
484 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.73 
 
 
454 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.34 
 
 
499 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.41 
 
 
453 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.6 
 
 
476 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  30.2 
 
 
468 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0287  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  21.67 
 
 
478 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.12 
 
 
483 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.29 
 
 
493 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.49 
 
 
492 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.57 
 
 
471 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.37 
 
 
476 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.29 
 
 
519 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.29 
 
 
519 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.08 
 
 
493 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.37 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>