More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2410 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
368 aa  743    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  57.14 
 
 
768 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  56.11 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  49.43 
 
 
376 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
336 aa  133  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  39.77 
 
 
374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
413 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
423 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
359 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
376 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
398 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
408 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
415 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
369 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
378 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
383 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
412 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 
426 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
439 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
399 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
419 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
379 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
373 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
412 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  23.2 
 
 
379 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
412 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 
346 aa  96.3  7e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
410 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
393 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  45.79 
 
 
453 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
434 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
396 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
380 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
410 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
405 aa  92.8  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
421 aa  92.8  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.29 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
409 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
377 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
414 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
411 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
355 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  23.16 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
446 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
448 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
440 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
413 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
397 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
377 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.33 
 
 
409 aa  89.4  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
518 aa  89.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.83 
 
 
378 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
409 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
390 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
353 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
371 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
387 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  21.51 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  29.33 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  28.85 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  27 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.42 
 
 
382 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
669 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
386 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
390 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>