More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0222 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  57.23 
 
 		 700 aa  770    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3200  elongation factor G  47.56 
 
 		 682 aa  641    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  50.59 
 
 		 684 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  100 
 
 		 683 aa  1377    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  58.47 
 
 		 688 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5542  elongation factor G  56.43 
 
 		 686 aa  733    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  48.82 
 
 		 680 aa  687    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  67.95 
 
 		 684 aa  956    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2663  elongation factor G  46.41 
 
 		 682 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6425  elongation factor G  57.27 
 
 		 681 aa  794    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1118  elongation factor G  46.27 
 
 		 682 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  56.55 
 
 		 730 aa  752    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4182  elongation factor G  55.29 
 
 		 686 aa  712    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000680  translation elongation factor G-related protein  44.84 
 
 		 674 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  37.77 
 
 		 695 aa  481  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  37.57 
 
 		 690 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  36.03 
 
 		 692 aa  449  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  35.32 
 
 		 679 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  35.8 
 
 		 688 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  35.71 
 
 		 696 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.75 
 
 		 691 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  35.6 
 
 		 682 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  36.91 
 
 		 680 aa  438  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  36.06 
 
 		 687 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  33.74 
 
 		 719 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  34.16 
 
 		 695 aa  428  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  35.19 
 
 		 685 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  33.57 
 
 		 694 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  35.06 
 
 		 697 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  35.25 
 
 		 683 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.39 
 
 		 683 aa  422  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  34.8 
 
 		 696 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  34.15 
 
 		 696 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  36.05 
 
 		 699 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  34.07 
 
 		 707 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  34.96 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  34.1 
 
 		 696 aa  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  35.67 
 
 		 682 aa  415  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  35.1 
 
 		 683 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  35.31 
 
 		 693 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  33.92 
 
 		 694 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  33.52 
 
 		 692 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  34.26 
 
 		 691 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.09 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  36.16 
 
 		 683 aa  405  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.45 
 
 		 697 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  36.34 
 
 		 686 aa  402  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  33.96 
 
 		 693 aa  401  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  34.33 
 
 		 703 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  33.48 
 
 		 691 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  32.51 
 
 		 693 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  34.92 
 
 		 656 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  33.48 
 
 		 691 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  33.67 
 
 		 670 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  32.57 
 
 		 694 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  35.76 
 
 		 691 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  33.72 
 
 		 691 aa  396  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  34.18 
 
 		 704 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  35.76 
 
 		 691 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  34.69 
 
 		 708 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  34.05 
 
 		 695 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.28 
 
 		 697 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  32.32 
 
 		 690 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  34.68 
 
 		 694 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  33.53 
 
 		 692 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.95 
 
 		 692 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  34.52 
 
 		 719 aa  395  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  33.52 
 
 		 703 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  33.04 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  34.79 
 
 		 697 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  32.81 
 
 		 697 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.9 
 
 		 701 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  33.19 
 
 		 691 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  32.66 
 
 		 697 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  33.43 
 
 		 691 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  33.77 
 
 		 697 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  33.58 
 
 		 667 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  34.3 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  32.76 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  32.95 
 
 		 692 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  33.33 
 
 		 673 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  31.96 
 
 		 691 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  33.72 
 
 		 704 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  34.57 
 
 		 692 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  33.29 
 
 		 706 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  34.67 
 
 		 701 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  35.07 
 
 		 677 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  32.08 
 
 		 701 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  31.84 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  31.56 
 
 		 694 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  32.9 
 
 		 692 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  33.33 
 
 		 698 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  33.91 
 
 		 699 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  34.24 
 
 		 704 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.67 
 
 		 686 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  33.48 
 
 		 697 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  33.62 
 
 		 673 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  33.48 
 
 		 697 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  33.48 
 
 		 689 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  32.46 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>