More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5747 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  100 
 
 
349 aa  705    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  67.24 
 
 
386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  66.86 
 
 
357 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.86 
 
 
357 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.86 
 
 
357 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.86 
 
 
357 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.86 
 
 
390 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.57 
 
 
357 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.28 
 
 
357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  67.61 
 
 
350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  68.5 
 
 
367 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  67.9 
 
 
375 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  68.42 
 
 
363 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  67.89 
 
 
355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  67.32 
 
 
358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  67.61 
 
 
354 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  67.89 
 
 
355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  67.99 
 
 
355 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  68.71 
 
 
354 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.67 
 
 
349 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  65.91 
 
 
369 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  66.86 
 
 
357 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.01 
 
 
362 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  65.73 
 
 
362 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  65.73 
 
 
362 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  65.91 
 
 
362 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.09 
 
 
369 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.48 
 
 
362 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  64.33 
 
 
362 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.69 
 
 
349 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.39 
 
 
349 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.85 
 
 
349 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.85 
 
 
349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  53.24 
 
 
349 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.96 
 
 
349 aa  345  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.14 
 
 
354 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  51.61 
 
 
345 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.78 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.36 
 
 
358 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.49 
 
 
344 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.45 
 
 
348 aa  331  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.31 
 
 
348 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  53.76 
 
 
348 aa  330  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.28 
 
 
357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  56.43 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.85 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.66 
 
 
360 aa  326  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.16 
 
 
349 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.33 
 
 
344 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.78 
 
 
344 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.78 
 
 
344 aa  318  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.45 
 
 
343 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.59 
 
 
348 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.25 
 
 
343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.69 
 
 
344 aa  312  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  50 
 
 
343 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.94 
 
 
344 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.44 
 
 
344 aa  295  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  49.12 
 
 
350 aa  294  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.28 
 
 
345 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.86 
 
 
359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  49.57 
 
 
345 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  50.43 
 
 
350 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.28 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  45.48 
 
 
344 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  50.3 
 
 
350 aa  276  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  46.08 
 
 
335 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.08 
 
 
334 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  46.44 
 
 
335 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  42.02 
 
 
371 aa  249  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  39.5 
 
 
351 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  39.71 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  41.64 
 
 
369 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  39.4 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  37.67 
 
 
381 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  33.33 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  33.14 
 
 
354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  32.65 
 
 
354 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 
320 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  33.53 
 
 
350 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.43 
 
 
335 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.81 
 
 
337 aa  189  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.55 
 
 
323 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.39 
 
 
323 aa  185  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.57 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.79 
 
 
343 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  34.04 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  33.81 
 
 
323 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  34.21 
 
 
349 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.61 
 
 
329 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  33.62 
 
 
323 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 
328 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 
350 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 
328 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.71 
 
 
394 aa  176  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  33.07 
 
 
361 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  33.77 
 
 
353 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.11 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.11 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.35 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>