More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4024 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  100 
 
 
326 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  74.84 
 
 
325 aa  488  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  72.06 
 
 
322 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  62.42 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  62.5 
 
 
321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  63.17 
 
 
318 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
321 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  59.56 
 
 
321 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  62.3 
 
 
315 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.17 
 
 
315 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  59.55 
 
 
316 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.17 
 
 
334 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.17 
 
 
334 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.17 
 
 
334 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.17 
 
 
334 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  61.54 
 
 
313 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  59.25 
 
 
320 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.17 
 
 
463 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  61.86 
 
 
313 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  62.86 
 
 
331 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  60.95 
 
 
315 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  60.63 
 
 
315 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  61.9 
 
 
315 aa  371  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  60.9 
 
 
313 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  60 
 
 
323 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  58.41 
 
 
317 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
315 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  57.05 
 
 
317 aa  364  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  60.38 
 
 
315 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  60.95 
 
 
320 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  59.37 
 
 
315 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  60.38 
 
 
315 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  59.37 
 
 
315 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  56.65 
 
 
314 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  61.34 
 
 
320 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  60.83 
 
 
316 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  57.69 
 
 
315 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  59.24 
 
 
316 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  56.37 
 
 
311 aa  353  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  57.69 
 
 
317 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  54.17 
 
 
316 aa  349  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  58.31 
 
 
324 aa  345  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  56.91 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  54.29 
 
 
316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  54.63 
 
 
315 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  53.04 
 
 
315 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  52.7 
 
 
315 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  54.17 
 
 
316 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  50.64 
 
 
314 aa  298  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  51.91 
 
 
321 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
321 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
321 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  45.99 
 
 
338 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  47.92 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  51.32 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  47.81 
 
 
323 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  51.92 
 
 
314 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  46.13 
 
 
325 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  44.79 
 
 
342 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  46.62 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  43.13 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  46.3 
 
 
305 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  44.63 
 
 
315 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  42.51 
 
 
341 aa  219  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.49 
 
 
332 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
333 aa  208  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  41.41 
 
 
353 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.69 
 
 
331 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
313 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
313 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
333 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  37.95 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1279  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0530409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  37.76 
 
 
331 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
337 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
326 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  37.61 
 
 
338 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
346 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  37.77 
 
 
325 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  40.56 
 
 
325 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  40.57 
 
 
326 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
326 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  37.19 
 
 
334 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  36.68 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  41.45 
 
 
309 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  40.71 
 
 
335 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  37.58 
 
 
358 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
324 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  36.99 
 
 
326 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  39.26 
 
 
346 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  41.78 
 
 
341 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  37.96 
 
 
348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  38.11 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  38.39 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>