More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5030 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  100 
 
 
388 aa  778    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  70.26 
 
 
389 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  68.05 
 
 
400 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  70.05 
 
 
393 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  70.31 
 
 
393 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  67.45 
 
 
394 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4811  cysteine desulfurase  70.34 
 
 
398 aa  521  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1929  cysteine desulfurase  59.31 
 
 
386 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 
388 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  47.68 
 
 
403 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.52 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  44.19 
 
 
392 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.97 
 
 
394 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.12 
 
 
384 aa  325  9e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.27 
 
 
384 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.9 
 
 
400 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  40.53 
 
 
383 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.15 
 
 
382 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.78 
 
 
394 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  42.56 
 
 
414 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.86 
 
 
398 aa  316  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.98 
 
 
402 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  42.64 
 
 
405 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  39.28 
 
 
382 aa  310  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.74 
 
 
394 aa  308  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.51 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  42.97 
 
 
404 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  42.12 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  43.96 
 
 
403 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.05 
 
 
396 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  44.82 
 
 
383 aa  302  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.3 
 
 
398 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  41.6 
 
 
405 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  42.78 
 
 
405 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  38.18 
 
 
404 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.97 
 
 
399 aa  300  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.12 
 
 
398 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.12 
 
 
398 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  41.09 
 
 
405 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  41.09 
 
 
405 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  41.94 
 
 
404 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  41.94 
 
 
404 aa  299  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  41.94 
 
 
404 aa  299  7e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  41.94 
 
 
404 aa  299  7e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  41.94 
 
 
404 aa  299  7e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  41.94 
 
 
404 aa  299  7e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  41.94 
 
 
404 aa  299  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  41.94 
 
 
404 aa  299  7e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  41.94 
 
 
404 aa  299  7e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.6 
 
 
396 aa  298  8e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  41.09 
 
 
430 aa  298  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.34 
 
 
407 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  41.34 
 
 
407 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  44.47 
 
 
385 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  41.6 
 
 
406 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  40.1 
 
 
389 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  43.12 
 
 
383 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  41.6 
 
 
405 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  40.57 
 
 
407 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  41.9 
 
 
404 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  41.09 
 
 
407 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  38.44 
 
 
398 aa  296  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  41.9 
 
 
404 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  42.97 
 
 
392 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  42.38 
 
 
403 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  41.49 
 
 
402 aa  296  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  41.86 
 
 
403 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  41.09 
 
 
407 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  41.09 
 
 
407 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  295  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  41.09 
 
 
407 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  41.13 
 
 
404 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  41.09 
 
 
407 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  44.89 
 
 
388 aa  295  8e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  42.12 
 
 
436 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  42.12 
 
 
436 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  41.6 
 
 
406 aa  295  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  41.39 
 
 
404 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  41.94 
 
 
404 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  41.84 
 
 
507 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  41.94 
 
 
404 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  41.65 
 
 
404 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  41.34 
 
 
406 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  41.49 
 
 
405 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
406 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1238  cysteine desulfurase IscS  41.69 
 
 
407 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.01856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  40.83 
 
 
407 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  41.34 
 
 
384 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  41.13 
 
 
404 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  41.69 
 
 
404 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  37.79 
 
 
406 aa  293  3e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  41.69 
 
 
404 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>