More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4554 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 245 aa  496  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.71 
 
 		 236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.96 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.07 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  62.7 
 
 		 240 aa  279  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  61.89 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2840  LuxR family two component transcriptional regulator  61.07 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 		 217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  41.67 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.59 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.17 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.93 
 
 		 217 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  38.59 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 209 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.18 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.91 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.11 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  37.34 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  38.49 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  38.49 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  38.49 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  38.49 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  37.35 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.49 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  39.42 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  39.42 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  39.42 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  39.42 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  39.42 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.6 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  39.42 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  35.39 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  39.42 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  39.42 
 
 		 215 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  39 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.6 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  39 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  34.98 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.76 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.76 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.1 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.34 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 217 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.6 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.6 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.6 
 
 		 215 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.95 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.02 
 
 		 218 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.08 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.4 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.4 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  37.34 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.64 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  37.3 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.78 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.95 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0303  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 214 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>