47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5391 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  304  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  59.44 
 
 		 193 aa  170  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  53.79 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  48.05 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  52.52 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  41.06 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  41.96 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  49.65 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  40.54 
 
 		 232 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  38.1 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  44.85 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  44.85 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  44.85 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  44.27 
 
 		 316 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  41.43 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  38 
 
 		 239 aa  97.1  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 237 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  42.95 
 
 		 241 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  39.04 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 251 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  31.94 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  38.24 
 
 		 244 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  28.95 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  27.21 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  32.19 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  23.4 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  26.85 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  31.21 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  26.77 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  30.56 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  31.21 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  27.15 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  27.89 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  28.39 
 
 		 179 aa  50.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  25.69 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  25 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  31.16 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  26.9 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  27.08 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  26.12 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  27.81 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  28.12 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  28.47 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>