More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3745 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3745  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 329 aa  681    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  decreased coverage  0.00432991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  45.51 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.58 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  41.25 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  43.96 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.51 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  45.23 
 
 		 372 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.22 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  45.23 
 
 		 372 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  45.23 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  41.76 
 
 		 402 aa  249  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.8 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  42.42 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  44.69 
 
 		 354 aa  245  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.35 
 
 		 380 aa  245  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  42.19 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  42.43 
 
 		 360 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 		 346 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.94 
 
 		 373 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.21 
 
 		 351 aa  241  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.31 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0444  hypothetical protein  41.21 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  43.57 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  41.35 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.92 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  42.55 
 
 		 362 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.81 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  40.25 
 
 		 356 aa  239  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  40.75 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  38.69 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  39.76 
 
 		 349 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  42.19 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  43.52 
 
 		 392 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.95 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  42.22 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  40.87 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.98 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  43.52 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.21 
 
 		 362 aa  235  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  41.85 
 
 		 382 aa  235  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  40.75 
 
 		 342 aa  235  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  41.23 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.51 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  42.68 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  43.17 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  40.24 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0483  radical SAM enzyme, Cfr family  39.51 
 
 		 350 aa  233  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0926837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  40.5 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.09 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.67 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.4 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.67 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.11 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.79 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.79 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.48 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.79 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.18 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.79 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.79 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.56 
 
 		 373 aa  232  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.31 
 
 		 363 aa  232  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.79 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  39.88 
 
 		 409 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  41.72 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2624  radical SAM enzyme, Cfr family  36.78 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  40.96 
 
 		 377 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  40.18 
 
 		 413 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.76 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.06 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.87 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.52 
 
 		 359 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0663  radical SAM enzyme, Cfr family  40.82 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0103846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  39.43 
 
 		 372 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2012  radical SAM enzyme, Cfr family  36.01 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.87 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  43.79 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.56 
 
 		 373 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.6 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  40.31 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.4 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.18 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  36.55 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.73 
 
 		 362 aa  228  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.73 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.56 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.73 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.73 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  40.31 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.73 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2871  radical SAM protein  40.62 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.73 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  38.26 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.73 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.73 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.04 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>