More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3047 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 470 aa  961    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  43.78 
 
 		 473 aa  358  9e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.11 
 
 		 503 aa  351  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.54 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  37.66 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.92 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  41.83 
 
 		 461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.61 
 
 		 476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.1 
 
 		 504 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.45 
 
 		 547 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  37.01 
 
 		 487 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  37.01 
 
 		 487 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  35.52 
 
 		 972 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 		 478 aa  279  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  34.85 
 
 		 921 aa  270  5e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  36.09 
 
 		 933 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.92 
 
 		 924 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 		 483 aa  261  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 		 482 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  36.44 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.34 
 
 		 481 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  35.71 
 
 		 489 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 480 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 		 493 aa  246  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.67 
 
 		 489 aa  246  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.51 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 		 484 aa  236  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.59 
 
 		 490 aa  230  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  33.81 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  35.43 
 
 		 488 aa  223  7e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  33.4 
 
 		 579 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 578 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  35.47 
 
 		 646 aa  216  8e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 		 678 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 488 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 		 573 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 		 570 aa  213  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 662 aa  212  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 577 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 664 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 		 634 aa  206  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 		 647 aa  206  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 		 501 aa  206  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 		 643 aa  206  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.18 
 
 		 574 aa  206  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  31.72 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  31.08 
 
 		 504 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  37.43 
 
 		 641 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.58 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.41 
 
 		 645 aa  203  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 		 493 aa  203  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.57 
 
 		 639 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.8 
 
 		 491 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  34.14 
 
 		 673 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  31.95 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  35.62 
 
 		 640 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.86 
 
 		 643 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  33.03 
 
 		 557 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.52 
 
 		 645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  32.71 
 
 		 557 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  32.2 
 
 		 492 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 954 aa  197  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 		 503 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  32.76 
 
 		 584 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.04 
 
 		 586 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  30.85 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.15 
 
 		 681 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 603 aa  193  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.97 
 
 		 610 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  31.46 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  33.41 
 
 		 771 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 		 636 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 		 646 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  33.73 
 
 		 800 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2144  penicillin-binding protein 2, putative  30.72 
 
 		 636 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1802  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 		 636 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 		 611 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 767 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 		 632 aa  191  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.57 
 
 		 647 aa  190  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 586 aa  190  5e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 		 672 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 		 646 aa  189  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  31.51 
 
 		 679 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.69 
 
 		 695 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 633 aa  187  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>