239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2078 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  62.74 
 
 		 216 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  49.52 
 
 		 211 aa  207  9e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.57 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  48.06 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  50.46 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  49.75 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.57 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  47.09 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  47.09 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  47.09 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.09 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  47.09 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  47.09 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  46.6 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  46.31 
 
 		 211 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  43.84 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  44.39 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  40.1 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  45.79 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  44.34 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  38.83 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  39.47 
 
 		 209 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  41.24 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  35.27 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  39.72 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  38.66 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  37.33 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  48.13 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  49.2 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  40.5 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  37.75 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  39.39 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  39.59 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  45.54 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  36.05 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  37.44 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  36.59 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  34.6 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00800  hypothetical protein  48.41 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.438932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  40.68 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2997  protein of unknown function UPF0029  45.93 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  40.78 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  40.78 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  39.39 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  39.79 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  39.01 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  36.41 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.63 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1690  hypothetical protein  41.21 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  46.06 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  35.57 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.1 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  36.67 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  41.21 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.29 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  42.77 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  42.77 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  42.62 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  36.52 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  32.66 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  36.84 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  36.65 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  41.45 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  33.68 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  47.2 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  34.72 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  35.23 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  34.76 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  38.95 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  34.2 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  35.6 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  34.15 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  40.23 
 
 		 232 aa  114  7.999999999999999e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  44.97 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  41.89 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  36.96 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  36.78 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  37.5 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0249  uncharacterized protein, YigZ family  39.04 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  36.21 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  35.68 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  34.04 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.16 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  37.42 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  34.07 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  36.67 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  34.27 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  37.13 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14920  hypothetical protein  41.94 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0239804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  39.34 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  40.35 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  35.83 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  31.09 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  34.27 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  34.03 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>