237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14920  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0239804  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2997  protein of unknown function UPF0029  71.09 
 
 
211 aa  277  9e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00800  hypothetical protein  54.76 
 
 
219 aa  206  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.438932  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  47.52 
 
 
213 aa  141  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  41.62 
 
 
216 aa  138  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  38.97 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  47.49 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  39.39 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  37.62 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  37.24 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  37.37 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  41.27 
 
 
219 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  36.22 
 
 
207 aa  124  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  39.69 
 
 
216 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  39.25 
 
 
201 aa  121  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  34.34 
 
 
205 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  32.86 
 
 
214 aa  121  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  35.15 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  36.87 
 
 
221 aa  118  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  53.66 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  40.21 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  34.2 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  35.38 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  37.56 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  37.44 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  35.2 
 
 
211 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  35.2 
 
 
211 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  38.6 
 
 
211 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  35.38 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  36.21 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  35.2 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.54 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.87 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  34.87 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  34.87 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  38.5 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  35.71 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.87 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  34.26 
 
 
213 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  34.69 
 
 
211 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  40.41 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  39.9 
 
 
303 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  41.8 
 
 
217 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  40.41 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  35.5 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  39.9 
 
 
303 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  39.9 
 
 
303 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.69 
 
 
211 aa  111  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  31.96 
 
 
205 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  35.42 
 
 
198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  37.04 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  40.36 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  40.36 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  40.36 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  36.36 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  37.5 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  33.51 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  33.85 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  40.48 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  40.11 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  40.74 
 
 
217 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  38.86 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  34.18 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  34.18 
 
 
201 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  38.51 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  38.83 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  41.86 
 
 
303 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  32.83 
 
 
204 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  37.82 
 
 
194 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  37.17 
 
 
213 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  35.9 
 
 
204 aa  104  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  36.41 
 
 
211 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  34.24 
 
 
207 aa  104  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  30.48 
 
 
205 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  42.94 
 
 
212 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  39.11 
 
 
194 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  34.24 
 
 
207 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1690  hypothetical protein  44.65 
 
 
213 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  40.37 
 
 
195 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  38.83 
 
 
290 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.34 
 
 
208 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  30.22 
 
 
208 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  35.59 
 
 
200 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  31.19 
 
 
204 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  31.34 
 
 
219 aa  101  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  31.22 
 
 
192 aa  101  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  45.59 
 
 
274 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  49.06 
 
 
242 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  42.05 
 
 
218 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  37.99 
 
 
194 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  28.86 
 
 
197 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  34.66 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  37.36 
 
 
205 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  35.96 
 
 
203 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  99.4  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  37.35 
 
 
190 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  31.44 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.8 
 
 
210 aa  99  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  31.31 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>