235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00800 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00800  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.438932  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14920  hypothetical protein  54.76 
 
 
211 aa  189  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0239804  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2997  protein of unknown function UPF0029  52.38 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  48.56 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  41.03 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  48.41 
 
 
219 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  43.82 
 
 
216 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  34.87 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  34.33 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  35.9 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  38.89 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  34.26 
 
 
214 aa  125  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  36.87 
 
 
206 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  41.28 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  34.21 
 
 
198 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  37.37 
 
 
204 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  37.69 
 
 
205 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.16 
 
 
212 aa  123  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  37 
 
 
208 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  32.8 
 
 
198 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  36.62 
 
 
210 aa  122  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  39.33 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  53.6 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  34.95 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  36.68 
 
 
211 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  35.11 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  35.11 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  35.11 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  33.51 
 
 
198 aa  118  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  34.66 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  34.41 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  36.93 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  30.05 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  37.31 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  33.01 
 
 
221 aa  115  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.2 
 
 
206 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  36.68 
 
 
194 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  37.71 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  42.05 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  45.56 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  36.68 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  36.19 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  37.31 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  38.27 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  34.69 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  37.37 
 
 
195 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.79 
 
 
194 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  38.65 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  35.45 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  36.84 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  36.32 
 
 
204 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  33.66 
 
 
211 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.66 
 
 
211 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  37.21 
 
 
204 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  36.08 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  37.13 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  34.16 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  34.16 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.16 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  32.72 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  33.66 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.02 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  34.16 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  35.71 
 
 
195 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  35.12 
 
 
210 aa  109  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  34.16 
 
 
211 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  34.16 
 
 
211 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  33.84 
 
 
211 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  34.78 
 
 
207 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  34.39 
 
 
195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  31.52 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  34.39 
 
 
195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  34.39 
 
 
195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  38.29 
 
 
201 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  33.98 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  38.5 
 
 
245 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  42.6 
 
 
212 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  34.34 
 
 
194 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  37.59 
 
 
192 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.04 
 
 
203 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  32.76 
 
 
172 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  48.7 
 
 
201 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  35.45 
 
 
290 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  37.82 
 
 
209 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  34.11 
 
 
216 aa  104  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  33.15 
 
 
193 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  44.44 
 
 
213 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  32.98 
 
 
204 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  34.55 
 
 
203 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  43.08 
 
 
203 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  34.39 
 
 
203 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  34.21 
 
 
190 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  37.28 
 
 
191 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  34.92 
 
 
303 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  45.08 
 
 
225 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  34.92 
 
 
303 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>