47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1942 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  38.46 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  32.79 
 
 		 465 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  41.67 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  34.76 
 
 		 205 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  34.15 
 
 		 200 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  37.1 
 
 		 173 aa  89.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  34.75 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  31.75 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  31.43 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  32.85 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  40.7 
 
 		 169 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  29.56 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  32.62 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  30.66 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  31.03 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  28.96 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  29.78 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  26.98 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  35.71 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  32.32 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  29.41 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  31.03 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  32.86 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  32.79 
 
 		 545 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  31.48 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  31.07 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  30 
 
 		 195 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 184 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  22.67 
 
 		 179 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  28.06 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.35 
 
 		 383 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  32.5 
 
 		 197 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  30.3 
 
 		 543 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  29.31 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3203  germination protein GerM  28.57 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.235419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  36.76 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  25.34 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  25.34 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  25.34 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  25.34 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  36.76 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  25.34 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  32 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  30.3 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  31 
 
 		 349 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>