53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1872 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  59.67 
 
 		 551 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  100 
 
 		 551 aa  1139    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  43.07 
 
 		 550 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  40.93 
 
 		 555 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  39.74 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  39.74 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  37.43 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  37.43 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  37.61 
 
 		 559 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  37.39 
 
 		 565 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  36.64 
 
 		 556 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  35.77 
 
 		 536 aa  329  7e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  36.45 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  36.98 
 
 		 562 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  35.37 
 
 		 546 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  35.14 
 
 		 545 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  37.47 
 
 		 552 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  36.69 
 
 		 488 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  37.59 
 
 		 467 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  35.07 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  36.6 
 
 		 352 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  31.48 
 
 		 540 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  31.61 
 
 		 478 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  30.42 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  26.54 
 
 		 490 aa  125  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  37.12 
 
 		 234 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  26.24 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  22.74 
 
 		 549 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  25.21 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  23.75 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  23.58 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  21.86 
 
 		 298 aa  53.5  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  21.86 
 
 		 298 aa  53.5  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  21.86 
 
 		 298 aa  53.5  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  21.86 
 
 		 298 aa  53.5  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  21.54 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  21.54 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  21.54 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  21.54 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  21.55 
 
 		 286 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  20.83 
 
 		 302 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  20.83 
 
 		 302 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  20.83 
 
 		 302 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  22.18 
 
 		 308 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  24.46 
 
 		 289 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  22.09 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  22.09 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  22.09 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  22.09 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  21.59 
 
 		 294 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  24.07 
 
 		 296 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  28.36 
 
 		 303 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  27.97 
 
 		 351 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>