More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6504 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  100 
 
 		 321 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.05 
 
 		 328 aa  451  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03605  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.33 
 
 		 328 aa  431  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.66 
 
 		 331 aa  421  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.44 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 327 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  58.88 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.18 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.3 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.11 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 		 328 aa  391  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.32 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.53 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.8 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  58.59 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.39 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.39 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.39 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.11 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  57.86 
 
 		 403 aa  378  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.07 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.8 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.69 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.83 
 
 		 326 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  57.28 
 
 		 324 aa  358  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.19 
 
 		 325 aa  354  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.19 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  54.25 
 
 		 336 aa  352  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.76 
 
 		 326 aa  352  5e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.63 
 
 		 333 aa  347  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.34 
 
 		 321 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.71 
 
 		 321 aa  345  5e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 		 326 aa  345  8e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 		 329 aa  344  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.84 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.86 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.11 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.37 
 
 		 339 aa  342  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1051  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.82 
 
 		 349 aa  341  8e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00488786  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.76 
 
 		 333 aa  341  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 		 336 aa  341  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.44 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.84 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.57 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.06 
 
 		 339 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.44 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.06 
 
 		 325 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  52.04 
 
 		 330 aa  339  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.2 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.44 
 
 		 333 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 		 340 aa  338  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.84 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 		 335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.09 
 
 		 331 aa  335  3.9999999999999995e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.92 
 
 		 333 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.71 
 
 		 330 aa  335  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 		 332 aa  335  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 337 aa  335  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 		 335 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.74 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.55 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.55 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.55 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.413701  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.31 
 
 		 351 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 334 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4049  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.55 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.23 
 
 		 340 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1822  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.96 
 
 		 336 aa  332  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0581253  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02451  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.42 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.87 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 334 aa  331  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.35 
 
 		 351 aa  331  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.35 
 
 		 351 aa  331  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.34 
 
 		 334 aa  331  9e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 315 aa  331  9e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 		 354 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 		 354 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 325 aa  330  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.29 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.24 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.57 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>