More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5227 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.32 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.22 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.91 
 
 
284 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  25.44 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.44 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.55 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 
287 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  36.08 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.39 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
287 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
323 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  23.25 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 
287 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 
287 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.99 
 
 
272 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 
270 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27.69 
 
 
263 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 
283 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
271 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.03 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.55 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
287 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 
277 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  24.77 
 
 
260 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
295 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
283 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  27.78 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 
288 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.21 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 
312 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.58 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
271 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  26.85 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
299 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
316 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  23.21 
 
 
276 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 
310 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  25.71 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
290 aa  59.3  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
267 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
277 aa  58.9  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05670  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.79 
 
 
267 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.493353  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
462 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
300 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
278 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  22.48 
 
 
260 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  21.53 
 
 
294 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
280 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  25.32 
 
 
263 aa  58.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
268 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
267 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>