More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1445 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1445  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2503  ABC transporter, ATP-binding protein  63.92 
 
 
253 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2578  ABC transporter, ATP-binding protein  63.92 
 
 
253 aa  332  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2513  ABC transporter, ATP-binding protein  64.31 
 
 
253 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2307  ABC transporter ATP-binding protein  63.53 
 
 
256 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00152592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2275  ABC transporter, ATP-binding protein  63.53 
 
 
256 aa  332  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2482  ABC transporter ATP-binding protein  63.53 
 
 
256 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2229  ABC transporter, ATP-binding protein  63.14 
 
 
256 aa  328  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00449183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2288  ABC transporter related  66.25 
 
 
238 aa  322  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3167  ABC transporter related protein  58.82 
 
 
252 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.351033  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0064  ABC transporter, ATP-binding protein  53.59 
 
 
252 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.91 
 
 
244 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1026  ABC transporter related  43.36 
 
 
251 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  43.81 
 
 
225 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  41.89 
 
 
259 aa  182  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  42.08 
 
 
253 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 
266 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  42.99 
 
 
239 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  38.72 
 
 
248 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3481  ABC transporter-related protein  41.52 
 
 
256 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
253 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
253 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
253 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  39.24 
 
 
707 aa  178  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0523  ABC transporter related  41.03 
 
 
254 aa  178  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  40.62 
 
 
240 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
262 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
253 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
253 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
253 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
253 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
233 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
253 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 
658 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
253 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  40.36 
 
 
253 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4950  bacitracin export ATP-binding protein BceA  40.18 
 
 
256 aa  175  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  38.67 
 
 
252 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  36.61 
 
 
253 aa  174  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
246 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4985  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4565  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4972  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  41.98 
 
 
668 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  41.98 
 
 
668 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  37.75 
 
 
648 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
648 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4956  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4723  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  40.54 
 
 
253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5201  bacitracin export ATP-binding protein BceA  40.93 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4946  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0279  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  39.65 
 
 
654 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  38.36 
 
 
228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  37.75 
 
 
648 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  41.15 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4557  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
256 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  39.56 
 
 
224 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  38.24 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
240 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 
241 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.75 
 
 
648 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  39.56 
 
 
224 aa  171  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40 
 
 
646 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
270 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
255 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4671  ABC transporter related  39.29 
 
 
256 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4964  bacitracin export ATP-binding protein BceA  38.84 
 
 
256 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
243 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  42.08 
 
 
668 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  39.91 
 
 
253 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  43.05 
 
 
258 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
255 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
255 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  40.69 
 
 
232 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
255 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.344281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  39.11 
 
 
228 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  43.63 
 
 
653 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2406  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
255 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>