39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1435 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 363 aa  737    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.49 
 
 		 762 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.8 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.3 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.28 
 
 		 540 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  23.88 
 
 		 964 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.91 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.79 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  45.45 
 
 		 546 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  26.25 
 
 		 238 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 546 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.65 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  21.78 
 
 		 1054 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  31.75 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.3 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.03 
 
 		 544 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  31.43 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0904  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.78 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146365  normal  0.280229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  29.85 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3427  hypothetical protein  32.23 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.8 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  32.39 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0941  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.49 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0224398  normal  0.101209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 128 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  28.36 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  25 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 465 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 269 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 160 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 170 aa  42.7  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  30.56 
 
 		 540 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>