More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0622 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  229  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  61.61 
 
 		 601 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  56.25 
 
 		 596 aa  137  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  55.36 
 
 		 607 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  55.36 
 
 		 598 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  55.36 
 
 		 605 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  57.14 
 
 		 624 aa  130  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  46.43 
 
 		 615 aa  122  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  49.11 
 
 		 626 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  49.11 
 
 		 595 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  49.11 
 
 		 595 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.54 
 
 		 597 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.54 
 
 		 597 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  44.64 
 
 		 594 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  41.96 
 
 		 593 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  43.44 
 
 		 610 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  41.96 
 
 		 604 aa  97.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  45.54 
 
 		 590 aa  95.9  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  41.96 
 
 		 586 aa  94.4  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.61 
 
 		 610 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  40.52 
 
 		 618 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  40.18 
 
 		 590 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  44.64 
 
 		 597 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  38.39 
 
 		 601 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  39.29 
 
 		 438 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  41.96 
 
 		 521 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  41.96 
 
 		 521 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  44.94 
 
 		 437 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.72 
 
 		 423 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  42.22 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.84 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  43.82 
 
 		 450 aa  77.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  42.57 
 
 		 536 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  42.57 
 
 		 536 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  39.47 
 
 		 443 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.14 
 
 		 554 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  41.96 
 
 		 243 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.63 
 
 		 558 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  34.23 
 
 		 557 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.73 
 
 		 555 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  35.29 
 
 		 903 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  35.09 
 
 		 897 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 860 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 873 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  34.21 
 
 		 918 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 872 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 872 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 		 882 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 		 874 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  33.04 
 
 		 903 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  34.78 
 
 		 860 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  38.46 
 
 		 819 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 		 872 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  39.6 
 
 		 817 aa  61.6  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 		 793 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1083  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.74 
 
 		 447 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 881 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  37.17 
 
 		 793 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  35.96 
 
 		 883 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  35.09 
 
 		 874 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  36.52 
 
 		 882 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  31.03 
 
 		 905 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  35.09 
 
 		 853 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  31.37 
 
 		 864 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 868 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  32.69 
 
 		 872 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  35.59 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  35.59 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 		 769 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  32 
 
 		 538 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  35.59 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  31.73 
 
 		 862 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  35.59 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  37.08 
 
 		 846 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  36.52 
 
 		 882 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  31.9 
 
 		 869 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  35.05 
 
 		 871 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  35.59 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  35.59 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  32.76 
 
 		 910 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  32.76 
 
 		 910 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  35.09 
 
 		 857 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  35.59 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  35.59 
 
 		 860 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  35.59 
 
 		 853 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  34.21 
 
 		 872 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  35.09 
 
 		 922 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  32.46 
 
 		 897 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  30.7 
 
 		 853 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1446  DNA mismatch repair protein MutS-like  34.82 
 
 		 1002 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.345088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  30.43 
 
 		 867 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  37.08 
 
 		 846 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  30.17 
 
 		 904 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  32.46 
 
 		 902 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  31.9 
 
 		 896 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  30.09 
 
 		 750 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 884 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 884 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 		 868 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 921 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>