47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0045 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  670    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  46.67 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4672  hypothetical protein  44.89 
 
 		 214 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2415  hypothetical protein  44.09 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  40.76 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1198  hypothetical protein  34.73 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5138  hypothetical protein  40.46 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0189  hypothetical protein  34.85 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2687  hypothetical protein  41.62 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2717  hypothetical protein  41.62 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122181  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2731  hypothetical protein  41.62 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.342321 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2696  hypothetical protein  41.14 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5524  putative cytoplasmic protein  38.5 
 
 		 196 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0134  hypothetical protein  44.97 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  37.1 
 
 		 503 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  36.2 
 
 		 503 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0113  hypothetical protein  42.11 
 
 		 252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0268  hypothetical protein  39.33 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0217918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2669  hypothetical protein  35.16 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.526313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1413  hypothetical protein  34.8 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.430861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0464  hypothetical protein  34.8 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000209316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0695  hypothetical protein  34.8 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0888  hypothetical protein  34.8 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1806  hypothetical protein  34.31 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1650  hypothetical protein  34.31 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1629  hypothetical protein  34.31 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0613071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1282  Ig domain-containing protein  25.94 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.592505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.21 
 
 		 667 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  33.67 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  31.87 
 
 		 671 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  30.43 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  30.53 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  34.02 
 
 		 646 aa  49.3  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  35.16 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1882  Lytic transglycosylase catalytic  29.03 
 
 		 715 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  30.11 
 
 		 168 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3636  hypothetical protein  25.48 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 666 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  31.82 
 
 		 597 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  45.8  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3377  hypothetical protein  25.71 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5526  hypothetical protein  30.11 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000157095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  26.88 
 
 		 179 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1626  hypothetical protein  26.67 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3760  hypothetical protein  25.71 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32550  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.782691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>