40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2303 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  49.02 
 
 		 818 aa  704    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  50.53 
 
 		 788 aa  698    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  53.21 
 
 		 784 aa  752    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  100 
 
 		 786 aa  1565    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  48.02 
 
 		 793 aa  629  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  47.18 
 
 		 798 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  50.08 
 
 		 886 aa  529  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  26.56 
 
 		 840 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  24.65 
 
 		 825 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  25.15 
 
 		 801 aa  177  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  24.88 
 
 		 839 aa  170  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  23.8 
 
 		 847 aa  161  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  24.29 
 
 		 809 aa  160  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  23.71 
 
 		 830 aa  156  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  24.42 
 
 		 901 aa  151  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  23.84 
 
 		 795 aa  150  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  22.79 
 
 		 812 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  26.58 
 
 		 805 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  23.22 
 
 		 819 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  24.66 
 
 		 728 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  31.43 
 
 		 836 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  25.31 
 
 		 821 aa  121  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  29.39 
 
 		 825 aa  107  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  29.1 
 
 		 800 aa  101  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  29.17 
 
 		 810 aa  97.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  22.94 
 
 		 726 aa  94  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  25.43 
 
 		 819 aa  89  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  24.5 
 
 		 821 aa  84  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  27.76 
 
 		 809 aa  77  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  25.81 
 
 		 815 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  23.51 
 
 		 856 aa  73.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  27.2 
 
 		 801 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  27.08 
 
 		 801 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  24.68 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  24.21 
 
 		 822 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  24.52 
 
 		 869 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  26.4 
 
 		 744 aa  48.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  22.14 
 
 		 739 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1047 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0883  membrane protein-like protein  37.93 
 
 		 962 aa  44.3  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000534965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>