26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1659 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  76.87 
 
 
147 aa  243  9e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  76.87 
 
 
147 aa  242  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  72.79 
 
 
174 aa  221  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  66.67 
 
 
147 aa  212  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  63.45 
 
 
148 aa  207  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  63.95 
 
 
147 aa  204  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  54.42 
 
 
161 aa  174  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  48.97 
 
 
147 aa  141  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  44.83 
 
 
168 aa  133  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  46.26 
 
 
147 aa  130  5e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  46.26 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  44.83 
 
 
147 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  35.62 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  36.49 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  35.14 
 
 
193 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  37.93 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  38.19 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  37.24 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  35.92 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  38.28 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  30.14 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  29.36 
 
 
183 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  25.36 
 
 
142 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  28.57 
 
 
141 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>