193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0403 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0403  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000114311  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  76.99 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  70 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0301  ribosome-binding factor A  69.09 
 
 		 119 aa  160  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  67.59 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1778  ribosome-binding factor A  67.89 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00495715  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1461  ribosome-binding factor A  65.45 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00371256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  35.51 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  37.38 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4166  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000106795  hitchhiker  0.00000000804111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1069  ribosome-binding factor A  36.45 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03290  ribosome-binding factor A  38.78 
 
 		 132 aa  66.6  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01761  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.138056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3629  ribosome-binding factor A  33.96 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0781  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  35.09 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  33.96 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  30.43 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  34.69 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  28.81 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  34.62 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0180  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  38.61 
 
 		 133 aa  57  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  39.6 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  28.32 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  26.5 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  37.62 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  38.61 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  32.63 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2030  ribosome-binding factor A  32.76 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0111953  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  30.36 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  27.35 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>