More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2498 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2498  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2842  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  53.55 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0340  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.79 
 
 
196 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0072  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49 
 
 
204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0660  cytosine/adenosine deaminase  46.35 
 
 
193 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.81 
 
 
190 aa  164  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1808  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.67 
 
 
191 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.0647304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.13 
 
 
190 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0239  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  46.35 
 
 
186 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000722464  hitchhiker  0.0000000000000386131 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0160  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.36 
 
 
112 aa  141  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0379  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.84 
 
 
201 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00104836  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04619  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  40.74 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0679  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.66 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.46 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  45 
 
 
154 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.23 
 
 
155 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_7208  predicted protein  35.77 
 
 
123 aa  87.8  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.472899  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.15 
 
 
155 aa  87  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.1 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.5 
 
 
159 aa  85.5  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  35.62 
 
 
163 aa  85.9  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  85.5  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  39.84 
 
 
157 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.59 
 
 
158 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.59 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.33 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  43.3 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.23 
 
 
157 aa  79  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.24 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  37.86 
 
 
153 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  38.94 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.28 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  37.3 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.29 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.44 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.82 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.83 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.46 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  35.09 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.18 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.2 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1744  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.54 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  36.7 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  38.74 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.38 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.04 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  38.71 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.49 
 
 
461 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  39.81 
 
 
153 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.86 
 
 
145 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.58 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.36 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  35.71 
 
 
158 aa  62.4  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  37.5 
 
 
177 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.85 
 
 
166 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.59 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.35 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.25 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.49 
 
 
155 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
165 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  35.58 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.36 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.08 
 
 
214 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.86 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.63 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38 
 
 
148 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  40.43 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.25 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.26 
 
 
168 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  25.45 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.92 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  38.3 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.07 
 
 
301 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.39 
 
 
163 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  38.54 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.19 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.83 
 
 
154 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.73 
 
 
190 aa  58.9  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  34.56 
 
 
171 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1267  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40 
 
 
169 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.46 
 
 
231 aa  58.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.19 
 
 
176 aa  58.9  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  34.17 
 
 
148 aa  58.2  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.19 
 
 
223 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  34.17 
 
 
148 aa  58.2  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  35.38 
 
 
157 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.31 
 
 
163 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.33 
 
 
157 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.81 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.98 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  38.3 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1457  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  33.04 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  33.04 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.17 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.39 
 
 
152 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.08 
 
 
161 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>