More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2105 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1648  Transketolase domain protein  52.37 
 
 		 799 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0324  hypothetical protein  54.99 
 
 		 792 aa  941    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10513  (pyruvate) Oxoisovalerate Dehydrogenase Alpha and Beta Fusion  64.41 
 
 		 801 aa  1093    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2105  Transketolase domain protein  100 
 
 		 781 aa  1626    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4914  Transketolase domain protein  55.51 
 
 		 801 aa  908    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1992  transketolase  53.11 
 
 		 802 aa  890    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3632  Transketolase domain protein  53.67 
 
 		 804 aa  912    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1509  Transketolase domain protein  57.23 
 
 		 807 aa  941    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277218  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4512  transketolase domain-containing protein  64.97 
 
 		 804 aa  1084    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  26 
 
 		 693 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  26.26 
 
 		 710 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  33.54 
 
 		 335 aa  162  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  33.14 
 
 		 332 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  33.44 
 
 		 332 aa  156  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  35.43 
 
 		 324 aa  157  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  34.5 
 
 		 325 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  34.47 
 
 		 324 aa  154  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  33.75 
 
 		 332 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.46 
 
 		 341 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  32.79 
 
 		 327 aa  153  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  33.33 
 
 		 337 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.02 
 
 		 337 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1330  transketolase, central region  32.92 
 
 		 343 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0296032  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  30.87 
 
 		 325 aa  152  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  33.13 
 
 		 332 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.99 
 
 		 351 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  33.65 
 
 		 325 aa  151  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.02 
 
 		 325 aa  151  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1077  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  35.66 
 
 		 327 aa  150  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  33.03 
 
 		 324 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.02 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  33.02 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.02 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.02 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.02 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.02 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  33.02 
 
 		 325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  31.46 
 
 		 327 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  33.98 
 
 		 330 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  31.46 
 
 		 327 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  32.7 
 
 		 325 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  33.11 
 
 		 326 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  33.45 
 
 		 326 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2156  transketolase central region  24.75 
 
 		 790 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.38 
 
 		 325 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  32.51 
 
 		 322 aa  147  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  30.32 
 
 		 320 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2479  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.02 
 
 		 328 aa  146  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  31.08 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  31.08 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  32.92 
 
 		 325 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  30.77 
 
 		 324 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  33.45 
 
 		 327 aa  145  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  33.45 
 
 		 327 aa  145  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.45 
 
 		 337 aa  145  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  35.63 
 
 		 325 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  30.96 
 
 		 326 aa  144  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  30.96 
 
 		 326 aa  144  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 692 aa  144  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  29.13 
 
 		 326 aa  144  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2110  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  31.15 
 
 		 326 aa  144  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.140374  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  31.92 
 
 		 328 aa  143  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  33.44 
 
 		 327 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2012  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  30.75 
 
 		 347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3066  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  30.75 
 
 		 347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1035  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  30.75 
 
 		 347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3192  2-oxoisovalerate dehydrogenase E1 component, beta subunit  30.75 
 
 		 347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.55833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1321  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  30.75 
 
 		 347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  33.66 
 
 		 709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2301  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  30.75 
 
 		 347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1410  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  30.75 
 
 		 334 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3464  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  30.75 
 
 		 352 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  32.41 
 
 		 327 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  31.06 
 
 		 337 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2303  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  29.81 
 
 		 347 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.405637  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4361  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.68 
 
 		 346 aa  141  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  26.59 
 
 		 736 aa  140  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.37 
 
 		 337 aa  140  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  29.74 
 
 		 327 aa  140  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0869  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  29.38 
 
 		 327 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  34.53 
 
 		 327 aa  140  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  31.06 
 
 		 338 aa  140  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4402  2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit  30.12 
 
 		 339 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1452  transketolase, central region  30.12 
 
 		 352 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  26.51 
 
 		 324 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  33.44 
 
 		 340 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  31.8 
 
 		 326 aa  139  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  32.17 
 
 		 327 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  30.82 
 
 		 327 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10131  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  29.6 
 
 		 327 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2340  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  33.92 
 
 		 325 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3963  transketolase central region  29.81 
 
 		 352 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0763  transketolase, central region  31.27 
 
 		 346 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0050  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  34.88 
 
 		 326 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0738  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  32.68 
 
 		 326 aa  139  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  31.27 
 
 		 346 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1217  transketolase central region  31.27 
 
 		 346 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  32.91 
 
 		 325 aa  138  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07151  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  31.72 
 
 		 327 aa  138  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.132194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  30.5 
 
 		 327 aa  138  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>